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Zuckerberg dévoile un atlas d'un milliard de protéines pour accélérer les médicaments
La base de données AlphaFold contient désormais la structure 3D de plus de 200 millions de protéines. Couvrant tous les règnes du vivant, elle devrait révolutionner la biologie.... Lire la suite
Pendant des décennies, certaines énigmes scientifiques semblaient hors de portée. Aujourd’hui, l’intelligence artificielle bouleverse le secteur de la recherche. En quelques jours ou heures, elle résout ce qui pouvait nécessiter des années d’expérimentations et ouvre la voie à des découvertes majeures…... Lire la suite
Et si les chercheurs disposaient enfin d’un moteur de recherche du vivant ? Grâce à une intelligence artificielle capable de cartographier plus d’un milliard de structures protéiques, le Biohub de Mark Zuckerberg dévoile un atlas inédit du monde moléculaire. Une ressource ouverte qui pourrait accélérer la découverte de médicaments, révéler des protéines encore inconnues et rapprocher la science d’un objectif longtemps jugé inaccessible : simuler virtuellement le fonctionnement des cellules humaines.
Un atlas géant, sorte de « carte du vivant moléculaire », permettant de naviguer au sein des milliards de protéines différentes et qui pourrait permettre d'accélérer l'identification de nouveaux médicaments ? C'est ce que viennent de mettre au point les chercheurs du BioHub.
Selon cet institut biomédical de la Chan Zuckerberg Initiative - l'organisme créé par Mark Zuckerberg et son épouse, la médecin et enseignante Priscilla Chan -, cet atlas devrait contribuer à « ouvrir une nouvelle voie aux chercheurs pour concevoir des protéines et accélérer les découvertes scientifiques ».
Certes, l'idée n'est pas nouvelle. En 2021, DeepMind, une société experte en intelligence artificielle détenue par Google, et l’EMB-EMI, l'Institut européen de bio-informatique, avaient créé AlphaFold, un atlas couvrant tous les règnes du vivant et qui comporte aujourd'hui 200 millions de structures protéiques différentes.
La base de données AlphaFold contient désormais la structure 3D de plus de 200 millions de protéines. Couvrant tous les règnes du vivant, elle devrait révolutionner la biologie.... Lire la suite
Mais l'annonce de BioHub est un pas vers l'avant encore plus important que celui fait à travers AlphaFold.
La base de données, nommée ESM Atlas, a été générée grâce à un outil d'intelligence artificielle particulièrement puissant nommé ESMFold2, un modèle de prédiction spécialisé dans les structures protéiques. Celui-ci a été entraîné à partir des données de séquences biologiques (génomique) accumulées depuis plusieurs décennies par la communauté scientifique mondiale : bactéries, virus, champignons, animaux, plantes... vivant dans tous les compartiments terrestres.
Proteins are the machinery of life. Scientists have cataloged billions of protein sequences—but their biology is still mostly unknown.Today we're releasing a world model of protein biology: a scientific engine for prediction, design, and discovery that consists of ESMFold2,… pic.twitter.com/Sej1plZ6Z7